Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDK5R1Q15078 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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