Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BRD3Q15059 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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