Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPD2Q15021 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPD2Q15021 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms