Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDE1CQ14123 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDE1CQ14123 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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