Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL9A2Q14055 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL9A2Q14055 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL9A2Q14055 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL9A2Q14055 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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