Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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