Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RUNX3Q13761 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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