Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CLN3Q13286 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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