Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SEMA3FQ13275 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SEMA3FQ13275 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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