Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SEMA3BQ13214 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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