Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CSTF3Q12996 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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