Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXD4Q12950 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXD4Q12950 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FOXD4Q12950 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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FOXD4Q12950 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXD4Q12950 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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FOXD4Q12950 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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FOXD4Q12950 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FOXD4Q12950 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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