Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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KCNMA1Q12791 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCNMA1Q12791 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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