Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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GTF3C1Q12789 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3C1Q12789 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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