Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARHGEF5Q12774 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARHGEF5Q12774 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms