Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SSRP1Q08945 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SSRP1Q08945 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms