Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPOCK1Q08629 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms