Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TFF3Q07654 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms