Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIGFQ07326 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIGFQ07326 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms