Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FMODQ06828 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms