Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EXOSC10Q01780 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms