Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MS4A2Q01362 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms