Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACTA1P68133 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms