Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBA52P62987 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms