Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD2P62316 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD2P62316 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD2P62316 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD2P62316 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNRPD2P62316 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms