Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
UFM1P61960 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
UFM1P61960 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UFM1P61960 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UFM1P61960 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms