Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA8P53708 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms