Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BCAMP50895 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BCAMP50895 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BCAMP50895 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BCAMP50895 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms