Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MAP2K4P45985 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MAP2K4P45985 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms