Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ARL4AP40617 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms