Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GGCXP38435 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GGCXP38435 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GGCXP38435 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GGCXP38435 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms