Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP6V1E1P36543 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms