Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATP5C1P36542 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms