Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM23P36406 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms