Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FLT4P35916 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FLT4P35916 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLT4P35916 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FLT4P35916 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLT4P35916 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FLT4P35916 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FLT4P35916 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FLT4P35916 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms