Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD13P35453 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD13P35453 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms