Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC9P31274 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC9P31274 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms