Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRABP1P29762 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRABP1P29762 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms