Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRB3P28472 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms