Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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