Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA6P23229 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms