Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ITGB6P18564 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms