Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ITGB4P16144 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ITGB4P16144 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms