Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A1P11836 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms