Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMC1P11047 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms