Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4BP0C0L5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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