Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HLA-DQB1P01920 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HLA-DQB1P01920 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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