Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PAPLNO95428 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAPLNO95428 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms