Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APOL3O95236 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms