Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG12O94817 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG12O94817 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG12O94817 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ATG12O94817 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATG12O94817 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATG12O94817 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms